Izolatoru funkcija ir virziena, kā atklāts augļu mušu eksperimentos. ciguns tika ievietots Drosophila melanogaster dzeltenajā lokusā y, kā rezultātā dažos audos tika inaktivēts y gēns, bet atsevišķos audos y gēns joprojām bija aktīvs, jo vienā čigānu galā bija izolatora secība. čigāns atšķirīgi ietekmēs gēnu aktivitāti, ja čigāns tiks ievietots dažādās vietās y lokusā. Tas ir tāpēc, ka y gēna aktivitāti regulē četri pastiprinātāji. Kad izolators tiek ievietots tieši pirms promotora, tas bloķē gēnu aktivāciju spārna lāpstiņā un ķermeņa kutikulas audos (no augšpus pastiprinātāja). Bet nebloķēja y gēna ekspresiju (no pakārtotā pastiprinātāja) saros un farsālajos nagos.
Tā kā daži pastiprinātāji atrodas augšpus un daži lejpus promotora, izolatora iedarbība nav atkarīga no izolatora stāvokļa attiecībā pret promotoru. Tāpēc izolatora efekta virzības iemesls nav īsti saprotams. Ir konstatēts, ka divi loki ietekmē izolatora darbību trans-aktivācijas veidā. S2J(Hw) gēna kodētais nukleoproteīns atpazīst izolatoru, un tikai pēc tam, kad izolators ar to saistās, tam ir izolējošs efekts. Kad šis gēns ir mutēts, izolācijas efekts tiek zaudēts, neskatoties uz izolatora ievietošanu y lokusā, un y tiek izteikts visos audos. Vēl viens lokuss ir mod(mdg 4). Pēc šī gēna mutācijas tā iedarbība ir tieši pretēja Su(Hw), tas ir, šie mutanti pastiprina izolācijas efektu, padarot izolatora izolācijas efektu vairs nevirzīgu un paplašinātu, tas ir, bloķē pastiprinātāju iedarbību uz abiem. augštecē un lejtecē.
